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產(chǎn)品課堂
NanoDrop Acclaro樣品智能檢測
分子生物學實驗流程一般是對樣本(組織/細胞)進行預(yù)處理后提取DNA、RNA、蛋白質(zhì)等生物大分子用于下游的深度分析,比如qPCR、測序、微陣列芯片、蛋白質(zhì)譜等。對生物大分子的濃度、純度、完整性、污染物殘留等進行質(zhì)控對下游檢測數(shù)據(jù)的準確性、客觀性和重復(fù)性至關(guān)重要。比如:qPCR時,DNA模板濃度過高或過低都會影響PCR擴增效率,導(dǎo)致得出不夠準確的定量結(jié)果;模板中殘留較多的苯酚會影響PCR酶的活性甚至使酶失去活性;進行轉(zhuǎn)染實驗時,質(zhì)粒的濃度與質(zhì)量未經(jīng)質(zhì)控會影響細胞轉(zhuǎn)染效率等。
NanoDrop One引入Thermo Scientific Acclaro樣品智能技術(shù)使用精細的數(shù)學算法來分析光譜數(shù)據(jù),自動鑒定出樣品中的污染物類型,如蛋白、苯酚、胍鹽、鹽酸胍等。一次檢測,全面分析。
樣本濃度 | A260/A280純度比值 | A260/A230純度比值 |
樣本光譜 | 純度不達標提示 | 樣本中的污染物提示 |
污染物光譜 | 矯正后樣本光譜圖 | 污染物的吸收值 |
矯正后的樣本濃度 | 導(dǎo)致結(jié)果異常的原因 | 解決方案推薦 |
Acclaro智能污染物檢測技術(shù)是基于依賴參考光譜庫,鑒定核酸及蛋白樣品中的污染物(如核酸提取過程殘留的苯酚和胍鹽,蛋白樣品中的DNA污染),并報告校正后的濃度。若核酸樣品的A260/A230比值超出可接受范圍,則會被標記,并提示可能是哪些污染物導(dǎo)致了比值偏低。利用A205蛋白肽骨架的吸光度進行定量,可以檢測蛋白樣品中的DNA污染,并校正A280結(jié)果。同時,Acclaro會標記問題樣品,并提供技術(shù)支持和故障排查,幫助研究人員進一步全面了解樣品質(zhì)量,幫助優(yōu)化樣本提取的實驗,避免下游應(yīng)用產(chǎn)生失誤。
當檢測到純度不符合要求的樣本時,軟件會自動報警提示,提供可能的污染物信息,并對樣本濃度進行矯正,在檢測界面上可以同時查看多個樣本的信息。如下圖所示,Acclaro用黃色三角標識符合標記了第四號dsDNA樣本可能存在污染物,提醒樣本存在污染。
點擊黃色三角標識,可以看到樣品中存在蛋白時,導(dǎo)致A260值增大(藍色光譜),從而dsDNA濃度比實際的高,污染物分析技術(shù)可將蛋白的含量(橙色光譜)從原始數(shù)據(jù)中扣除,從而得到矯正后正確的DNA濃度(綠色光譜)。
Thermo Scientific Acclaro樣品智能技術(shù),采用嵌入式傳感器和數(shù)字影像分析技術(shù),每次進行樣本檢測之前,對樣本液柱先進行數(shù)碼成像,分析液柱完整性和氣泡的情況,確保檢測的可靠性。