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操作規(guī)程

歐盟關(guān)于類器官和類器官相關(guān)技術(shù)的操作指南

       在類器官研究中,類器官模型質(zhì)量的長(zhǎng)期穩(wěn)定性和可重復(fù)性最為關(guān)鍵。而類器官全流程操作及構(gòu)建質(zhì)量評(píng)估方法的體系化、標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè),確保不同實(shí)驗(yàn)室之間的類器官培養(yǎng)結(jié)果具有可比性,對(duì)推動(dòng)類器官技術(shù)從實(shí)驗(yàn)室研究走向臨床應(yīng)用與產(chǎn)業(yè)化發(fā)展而言,具有重要意義。

       類器官標(biāo)準(zhǔn)化范圍須覆蓋類器官制備操作的全流程,應(yīng)包括用于類器官培養(yǎng)的干細(xì)胞的準(zhǔn)備、內(nèi)外源性誘導(dǎo)分化因子的種類選擇、劑量和時(shí)機(jī)、培養(yǎng)環(huán)境的物理/化學(xué)特性、實(shí)驗(yàn)過程質(zhì)量控制等全要素。據(jù)悉,為推動(dòng)類器官產(chǎn)業(yè)的標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)展,默克、諾華等大型跨國(guó)藥企組成的國(guó)際藥物研發(fā)創(chuàng)新與質(zhì)量聯(lián)盟(IQ Consortium),已發(fā)布了肝、腎、肺等類器官芯片模型行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)[1]。

       自2022年《人胃腸上皮組織類器官的構(gòu)建與保藏操作指南》發(fā)布實(shí)施以來,國(guó)內(nèi)已出臺(tái)12部類器官相關(guān)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn),其中一半為各種腫瘤類器官標(biāo)準(zhǔn),非腫瘤類器官僅涉及胃、腸肝臟等少數(shù)幾種消化系統(tǒng)類器官。國(guó)內(nèi)外研究熱點(diǎn)類器官、疾病模型,如腦類器官、肺類器官、腎臟類器官等及臨床常見病、基因遺傳性疾病模型,基本屬于空白狀態(tài)。已發(fā)布的團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)中,動(dòng)物組織來源干細(xì)胞的誘導(dǎo)操作環(huán)節(jié)相關(guān)內(nèi)容欠缺,依然處于不完善狀態(tài)。國(guó)家層面類器官技術(shù)相關(guān)的基礎(chǔ)性標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范尚未形成[2]。

頒布時(shí)間

標(biāo)準(zhǔn)文件名稱

標(biāo)準(zhǔn)頒布團(tuán)體

2022.03.28

人胃腸上皮組織類器官的構(gòu)建與保藏操作指南(T/CMBA 017-2022)

中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)

2022.09.20

人源肺癌類器官培養(yǎng)技術(shù)規(guī)范(T/SHSYCXH 12-2022)

上海市遺傳學(xué)會(huì)

2022.09.23

人腸癌類器官(T/CSCB 0006-2022)

中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)協(xié)會(huì)

2022.09.23

人腸道類器官(T/CSCB 0005-2022)

中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)協(xié)會(huì)

2023.02.22

人正常乳腺及乳腺癌類器官制備、凍存、復(fù)蘇和鑒定操作指南(T/CMBA 020-2023)

中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)

2023.06.29

腦腫瘤類器官模型構(gòu)建技術(shù)規(guī)范(T/SHDSGY 167-2023)

上海都市型工業(yè)協(xié)會(huì)

2023.07.20

人肝祖細(xì)胞類器官構(gòu)建、質(zhì)量控制與保藏操作指南(T/CRHA 017-2023)

中國(guó)研究型醫(yī)院學(xué)會(huì)

2023.07.20

人肝膽腫瘤細(xì)胞類器官構(gòu)建、質(zhì)量控制與保藏操作指南(T/CRHA 018-2023)

中國(guó)研究型醫(yī)院學(xué)會(huì)

2023.07.20

人膽系上皮組織類器官構(gòu)建、質(zhì)量控制與保藏操作指南(T/CRHA 019-2023)

中國(guó)研究型醫(yī)院學(xué)會(huì)

2024.03.25

人肝內(nèi)膽管癌類器官培養(yǎng)與鑒定(T/QMHIPA 001-2024

青島市醫(yī)養(yǎng)健康產(chǎn)業(yè)促進(jìn)會(huì)

2024.05.23

人胃癌類器官構(gòu)建、質(zhì)量控制與保藏(T/1984CACA 1-2024)

中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)

2024.05.20

基于人源肝臟類器官的藥物肝臟毒性評(píng)價(jià)技術(shù)(T/CRHA 052-2024)

中國(guó)研究型醫(yī)院學(xué)會(huì)

       歐洲是類器官實(shí)驗(yàn)技術(shù)的最早誕生地,也是類器官相關(guān)活動(dòng)規(guī)范化的倡導(dǎo)者。HYBRIDA Project為歐盟“地平線2020”計(jì)劃框架下資助的項(xiàng)目,目標(biāo)是為類器官的研究和相關(guān)技術(shù)中嵌入全面的倫理學(xué)框架,確保所有涉及類器官的研究均以合乎倫理且科學(xué)負(fù)責(zé)的方式進(jìn)行[3]。在2021年類器官研究資助計(jì)劃HYBRIDA Project啟動(dòng)后,歐盟即召集英國(guó)、法國(guó)、荷蘭、丹麥、比利時(shí)和挪威等國(guó)科學(xué)家著手類器官相關(guān)技術(shù)規(guī)范——《關(guān)于類器官和類器官相關(guān)技術(shù)的操作指南》的編制。該指南在歐盟內(nèi)部多次討論,于2024年10月審定并正式頒布施行[3]。

 

一、HYBRIDA研究項(xiàng)目主要技術(shù)成就

       HYBRIDA項(xiàng)目最重要成果是2024年10月頒布的文件《關(guān)于類器官和類器官相關(guān)技術(shù)的操作指南》(D5.1: Operational guidelines regarding organoids and organoid-related technologies, Revision 8.8),簡(jiǎn)稱HYBRIDA操作指南。

       HYBRIDA操作指南代表了類器官及類器官相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域的規(guī)范基礎(chǔ),旨在確保在類器官及相關(guān)技術(shù)上的可靠研究、開發(fā)和生產(chǎn)工作,確??茖W(xué)知識(shí)建立在可靠的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,研究結(jié)果的報(bào)告具有可比較性。同時(shí),這些指導(dǎo)原則還為資助機(jī)構(gòu)或其他評(píng)估委員會(huì)提供了一套簡(jiǎn)單規(guī)范,方便對(duì)研究工作的評(píng)估和評(píng)價(jià)。因此,遵循操作指南有助于在參與器官類研究的各方利益相關(guān)者之間建立信任,使得研究人員、項(xiàng)目提案評(píng)估人員可以進(jìn)行準(zhǔn)確而自信的技術(shù)交流。                                              

圖6 HYBRIDA指南對(duì)類器官技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用的指導(dǎo)意義.jpg

       近年來,類器官及相關(guān)領(lǐng)域的研究已成為生物醫(yī)學(xué)科學(xué)的重要領(lǐng)域。由于其新穎性和混合性(hybridity),類器官的精確定義仍需闡述。HYBRIDA指南根據(jù)《Progress and potential in organoid research》將類器官的定義為“由干細(xì)胞或祖細(xì)胞(progenitor)衍生,在較小的尺度上重現(xiàn)其所對(duì)應(yīng)組織器官的解剖構(gòu)造和多細(xì)胞組合特征,并再現(xiàn)組織層面一些基本功能的多細(xì)胞三維結(jié)構(gòu)”。類器官通常只能盡管表現(xiàn)出一些被模擬真實(shí)器官較為簡(jiǎn)單的特征。由于缺乏血管化(vascularisation)、神經(jīng)支配(innervation)和免疫系統(tǒng)支持,既無法完全復(fù)制天然器官的精細(xì)結(jié)構(gòu)和功能,又缺少與器官系統(tǒng)內(nèi)部復(fù)雜相互作用。還因受限于自身尺寸和規(guī)模,類器官無法完整精確重現(xiàn)靶標(biāo)器官內(nèi)發(fā)生的生理過程、全部功能和功能調(diào)控復(fù)雜性。類器官并非完整器官的精確復(fù)制品,應(yīng)將其描述為體外模型,以凸顯其獨(dú)特屬性、模擬能力和局限性。這有助于研究人員和公眾更好地理解其潛在應(yīng)用及其對(duì)生物醫(yī)學(xué)研究的貢獻(xiàn)。HYBRIDA指南指出,合理的命名是研究誠信標(biāo)準(zhǔn)的一部分,是研究人員的一種承諾。將類器官稱為“微型器官(mini-organs)”不僅不正確的,還被視為一種傳播錯(cuò)誤信息的不當(dāng)行為,會(huì)危機(jī)科學(xué)發(fā)展和公眾信任。

       HYBRIDA操作指南中的《使用類器官進(jìn)行科學(xué)和倫理研究的評(píng)估清單》(Evaluation Checklist for Scientific and Ethical Studies Using Organoids) ,分別為類器官技術(shù)研究有關(guān)提案的科學(xué)評(píng)估機(jī)構(gòu)、研究人員建立了各自獨(dú)立、又存在密切關(guān)聯(lián)的技術(shù)規(guī)范。類器官研究人員適用的是其中的《關(guān)于類器官及用途的最低限度信息標(biāo)準(zhǔn)》(Minimum Information about Organoids and their Use, MIAOU)部分。

 

二、《關(guān)于類器官及用途的最低限度信息標(biāo)準(zhǔn)》的指導(dǎo)意義

       MIAOU技術(shù)信息標(biāo)準(zhǔn)主要是作為科學(xué)界內(nèi)類器官的生產(chǎn)(production)、表征(characterization)和使用的質(zhì)量管理流程而頒布的。其目的側(cè)重于引導(dǎo)、鼓勵(lì)類器官研究人員以標(biāo)準(zhǔn)化格式報(bào)告類研器官究數(shù)據(jù)。通過對(duì)實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、類器官制造(fabrication)、表征、功能和最終應(yīng)用目的等基本技術(shù)細(xì)節(jié)信息的記錄和準(zhǔn)確描述,為每批類器官實(shí)驗(yàn)創(chuàng)建一個(gè)基本的、可信的信息清單(元數(shù)據(jù)),確保確保所有工作材料和方法的完整性(integrity)、類器官應(yīng)用的有效性(validity)或合理性(rationality)。這些指導(dǎo)原則將提高實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部及之間及不同組織類器官來源、樣品批次研究間的可重復(fù)性(reproducibility)、可復(fù)制性(replicability)和,促進(jìn)類器官生產(chǎn)穩(wěn)健性,方便研究人員自信地與其他科學(xué)家分享研究經(jīng)驗(yàn)和重要發(fā)現(xiàn),不僅可使目標(biāo)受眾更好地理解和評(píng)估這項(xiàng)工作的質(zhì)量,還可預(yù)防研究的不當(dāng)行為和報(bào)告發(fā)布后引發(fā)公眾誤解的發(fā)生。

       為了能夠真實(shí)評(píng)估研究報(bào)告的質(zhì)量,MIAOU標(biāo)準(zhǔn)信息規(guī)范規(guī)定了每批次的類器官實(shí)驗(yàn)都需提供的標(biāo)準(zhǔn)信息(standard information)或叫做元數(shù)據(jù)(metadata)要素。

       這些可公開的要素主要包括實(shí)驗(yàn)材料提供者提交的組織/細(xì)胞來源的描述、獲取協(xié)議(procurement protocols)、原材料的驗(yàn)證和保存、所使用的實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)庫,以及每個(gè)組織層級(jí)(如生物樣本庫)所采用的培養(yǎng)和分化流程(culture and differentiation protocols)及質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)(quality control criteria)。其目的主要是便于接收類器官的研究人員直接引用上述描述和表征類器官的數(shù)據(jù)(組學(xué)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),成像形態(tài)數(shù)據(jù)和功能檢測(cè)數(shù)據(jù))。

       此外,元數(shù)據(jù)還應(yīng)包含在相關(guān)司法管轄區(qū)遵守的所有監(jiān)管要素,包括使用類器官條款的材料轉(zhuǎn)移協(xié)議、患者知情同意書的驗(yàn)證、從患者細(xì)胞創(chuàng)建類器官所需的監(jiān)管機(jī)構(gòu)授權(quán)、實(shí)驗(yàn)材料收集聲明,必要時(shí)還需附帶材料轉(zhuǎn)移聲明,以避免接收研究者的研究失去倫理基礎(chǔ)。


三、《關(guān)于類器官及用途的最低限度信息標(biāo)準(zhǔn)》的內(nèi)容

       MIAOU標(biāo)準(zhǔn)信息規(guī)范的內(nèi)容分為項(xiàng)目識(shí)別、實(shí)驗(yàn)材料來源、類器官的生成、類器官表征和類器官的使用五個(gè)部分。被設(shè)計(jì)成網(wǎng)絡(luò)版調(diào)查問卷的方式,研究人員可通過French GDR Organoids(https://gdr-organoides.cnrs.fr)、歐洲誘導(dǎo)多能干細(xì)胞庫EBiSChttps://https://ebisc.org)或人類多能干細(xì)胞注冊(cè)中心hPSCreghttps://hpscreg.eu)平臺(tái)提交MIAOU標(biāo)準(zhǔn)所需信息。

Section 1. Identification Of The Project(項(xiàng)目識(shí)別)

       項(xiàng)目識(shí)別環(huán)節(jié)問卷內(nèi)容旨在使研究者對(duì)特定類器官研究項(xiàng)目的類器官未來用途的類別(基礎(chǔ)研究,生物生產(chǎn),臨床前研究,臨床使用)及應(yīng)用范圍的限制進(jìn)行明確界定。

MIAOU在線問卷問題

反饋

參考中文備注

Project Title


研究項(xiàng)目名稱

Acronym Of The Project (if any)


研究項(xiàng)目首字母縮略詞(如有)

Type of Organoid



Organoid for Basic Research

YES/NO

用于基礎(chǔ)研究的類器官

Factoroid (Organoid for Bioproduction)

YES/NO

用于生物生產(chǎn)的類器官

Organoid for Preclinical Research

YES/NO

用于臨床前研究的類器官

Organoid for Clinical Use

YES/NO

臨床用類器官

Others (If Yes, Specify)

YES/NO

其他(如有則需明確)

Name of The Organoid


如類器官已有共識(shí)命名則應(yīng)使用該命名,避免用"迷你腸/迷你大腦/合成大腦"等錯(cuò)誤名稱

Purpose of The Project


描述項(xiàng)目的目的是什么,包括適當(dāng)?shù)谋O(jiān)管文件

 

Section 2. Source Material (實(shí)驗(yàn)材料來源)

       實(shí)驗(yàn)源材料環(huán)節(jié)問卷內(nèi)容旨在使研究者提供以下4個(gè)方面的關(guān)鍵要素信息:

       1)符合美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(American Type Culture Collection, ATCC)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的類器官來源干細(xì)胞材料的元數(shù)據(jù)信息(metadata),涵蓋細(xì)胞材料的批次(batch)、結(jié)構(gòu)(structural)、形態(tài)和功能數(shù)據(jù)(morphological and functional)數(shù)據(jù)信息,樣品維護(hù)和保存方案(maintenance and preservation protocol)信息,細(xì)胞捐獻(xiàn)者簽署的知情同意書材料;

       2)合法收集細(xì)胞的聲明:同意將人體成分樣本用于科學(xué)目的的保存與制備活動(dòng)的聲明或授權(quán)(強(qiáng)制性要求);

       3)對(duì)起始細(xì)胞材料可能存在的技術(shù)偏差(如細(xì)胞系、遺傳特征、傳代數(shù)等)的監(jiān)控;

       4)符合監(jiān)管法規(guī)文件和醫(yī)學(xué)倫理(捐獻(xiàn)者知情同意的使用限制)的證明材料(如果適用)。

MIAOU在線問卷問題

反饋

參考中文備注

Does   your research involve human material?

YES/NO

類器官研究涉及人體材料嗎?

If   YES:



Is the material obtained from volunteers?

YES/NO

材料是否來自志愿者?

Has   informed consent been obtained?

YES/NO

是否獲得知情同意?

Provide   details of the informed consent:


提供知情同意書的詳細(xì)信息

Is the volunteer a patient?

YES/NO

材料是否來自患者志愿者?

Is the genetic identity at arrival known?

YES/NO

材料接收時(shí)遺傳身份是否已知?

If  starting material is obtained from a biopsy, are descriptors known

(gender, age, anatomical regions, diagnosis, viral status, etc.)?

YES/NO

人體組織活檢是否了解取材患者:

性別、年齡、解剖區(qū)域、診斷及病毒狀態(tài)等?

Please   list items.


請(qǐng)列出相關(guān)信息。

Does the sponsor of the research hold clinical data on the patient?

YES/NO

研究者是否持有患者臨床數(shù)據(jù)?

Is the laboratory authorised to prepare and conserve human body elements for scientific purposes?

YES/NO

實(shí)驗(yàn)室是否有權(quán)制備備和保存人體材料?

Give details and references of the collection declaration.


提供收集聲明的詳細(xì)信息和參考。




Is   the starting material a cell line?

YES/NO

起始材料是否為細(xì)胞系?

If   YES:



Is   the genetic identity at arrival known?

YES/NO

材料接收時(shí)其遺傳身份是否已知?

Please   specify

(DNA sequence, SNPs, PCR, STR, CGH array, etc.)


具體說明(DNA序列、SNP、PCR、STR、CGH陣列等)

Is   there genetic quality control

(karyotype,   STR, PCR, etc.)?

YES/NO

是否有基因質(zhì)量控制(核型、STR、PCR等)?

Please   describe.


請(qǐng)說明。

Is the cell line functionally validated

(differentiation test for pluripotency of iPSC, permeability tests for epithelial cell, etc.)?

YES/NO

細(xì)胞系是否經(jīng)過功能驗(yàn)證

(iPSC多能性分化實(shí)驗(yàn)、上皮細(xì)胞滲透性實(shí)驗(yàn)等)?

Please describe.


請(qǐng)說明。

Is the cell identity validated after X passages?

YES/NO

細(xì)胞身份在經(jīng)過X次傳代后是否經(jīng)過驗(yàn)證?

Specify X.


請(qǐng)說明。

Are   cell type markers identified

(example:   marker name, detection method, target value)?

YES/NO

是否確定了細(xì)胞類型標(biāo)記物

(如:標(biāo)記物名稱、檢測(cè)方法、目標(biāo)值)?

Please   list.


請(qǐng)列出。

Is the number of passages at arrival known.

YES/NO

材料接收時(shí)傳代數(shù)是否已知。

Is the number of possible, or required, passages before the genesis of organoids defined?

YES/NO

在器官原體形成之前,傳代數(shù)是否已確定?

Are   the storage conditions known?

YES/NO

是否已知儲(chǔ)存條件?

Please   describe preservation protocol

(culture,   freezing, thawing protocol, storage modalities)


請(qǐng)描述保存方案

(培養(yǎng)、冷凍、解凍方案、儲(chǔ)存方式)

Does   the material contain mutations

(genetic   disease)?

YES/NO

材料是否含有突變(遺傳疾?。?/span>

Is   the sanitary status known?

YES/NO

材料的衛(wèi)生潔凈狀況是否已知?

Please   give details of tests

(mycoplasma, bacteriological, fungal, etc.)


請(qǐng)?zhí)峁z測(cè)詳情(支原體、細(xì)菌學(xué)、真菌等)。




Is the starting material primary cells from patients?

YES/NO

起始材料是否為患者原代細(xì)胞?

If   YES:



Is the genetic identity at arrival known?

YES/NO

材料接收時(shí)遺傳身份是否已知?

Please   specify

(DNA sequence, SNPs, PCR, STR, CGH array, etc.)


具體說明(DNA序列、SNPs、PCR、STR、CGH陣列等)

Is there genetic quality control

(karyotype, STR, PCR, etc.)?

YES/NO

是否有基因質(zhì)量控制(核型、STR、PCR等)?

Please   describe.


請(qǐng)說明。

Is the cell line functionally validated

(differentiation test for pluripotency of iPSCs, permeability tests for epithelial cell, etc.)

YES/NO

細(xì)胞系是否經(jīng)過功能驗(yàn)證

(iPSCs的多能性分化實(shí)驗(yàn)、上皮細(xì)胞的滲透性實(shí)驗(yàn)等)。

Please   describe.


請(qǐng)說明。

Is the cell identity validated after X passages?

YES/NO

經(jīng)過X次傳代后是否確認(rèn)了細(xì)胞特性?

Specify   X.


定義傳代數(shù)

Are cell type markers identified

(example: marker name, detection method, target value)?

YES/NO

是否確定了細(xì)胞類型標(biāo)記物

(如:標(biāo)記物名稱、檢測(cè)方法、目標(biāo)值)?

Please   list.


請(qǐng)列出。

Is the number of passages at arrival known?

YES/NO

材料接收時(shí)傳代數(shù)量是否已知?

Is the number of possible, or required, passages before the genesis of organoids known?

YES/NO

在類器官生成前是否已知所用細(xì)胞傳代數(shù)?

Are the storage conditions known?

YES/NO

是否已知儲(chǔ)存條件?

Please describe preservation protocol

(culture, freezing, thawing protocol, storage modalities).


描述保存方案(培養(yǎng)、冷凍、解凍方案、儲(chǔ)存方式)。

Does the material contain mutations

(genetic   disease)?

YES/NO

材料是否含有遺傳突變疾???

Is   the sanitary status known?

YES/NO

衛(wèi)生狀況是否已知?

Please   give details of tests

(mycoplasma, bacteriological, fungal, etc.)


提供檢測(cè)詳情(支原體、細(xì)菌學(xué)、真菌等)




Are   the cell culture conditions precisely described?

YES/NO

是否準(zhǔn)確描述了細(xì)胞培養(yǎng)條件?

If   YES:



Are   the culture conditions well defined?

YES/NO

培養(yǎng)條件是否明確?

Provide details of culture conditions

(composition of culture media, nature, origin and quantities of supplements used

 - e.g. glucose, serum, antibiotics, growth factors etc.)


提供培養(yǎng)基、性質(zhì)、來源、所用補(bǔ)充物的詳細(xì)信息

(生長(zhǎng)因子、葡萄糖、血清、抗生素、CO2/O2濃度等)

Are the nature and treatment of the substrates well described?

YES/NO

基質(zhì)的性質(zhì)和處理是否描述得當(dāng)?

Are the seeding conditions well described?

YES/NO

接種條件是否描述清楚?

Is the frequency of media changes defined?

YES/NO

是否描述了培養(yǎng)基更新頻率?

Are O2/CO2 concentrations given?

YES/NO

是否給出了細(xì)胞培養(yǎng)的O2/CO2濃度?

Provide details of the culture conditions


提供培養(yǎng)條件的詳細(xì)信息

What are the storage conditions for the lines or cells?


細(xì)胞株或細(xì)胞系儲(chǔ)存條件是什么?

Are there cell master banks?

YES/NO

是否有細(xì)胞主庫?

Describe protocols and drift control.


描述協(xié)議和漂移控制。

Are there cell working banks?

YES/NO

是否有細(xì)胞工作庫?

Describe protocols and drift control.


描述協(xié)議和漂移控制。

Are storage conditions indicated?

YES/NO

是否指明了儲(chǔ)存條件?

Describe   the freezing and thawing protocol.


描述冷凍和解凍方案。

Are   the storage modalities given?

YES/NO

是否提供了儲(chǔ)存方式?

Please   specify.


請(qǐng)說明。

 

Section 3. Manufacturing of The Organoid(類器官的生成)

       關(guān)于類器官生成過程,關(guān)鍵要素涉及生成類器官所需干細(xì)胞分化方案(differentiation protocols)和類器官生成方案(organoid generation)兩個(gè)環(huán)節(jié)。MIAOU的問卷包括分化因子列表(table of differentiation factors)、時(shí)間線(timelines)、培養(yǎng)方案(culture protocols)、純化方案(purification protocols),必要時(shí)還包括維護(hù)和保存方案(maintenance and preservation protocols)等事項(xiàng)信息。

MIAOU在線問卷問題

反饋

參考中文備注

Does   the project include 2D differentiation?

YES/NO

項(xiàng)目是否包括2D分化?

If   YES:



Provide details on culture media, nature, origin, supplements used

(e.g.   growth factors glucose, serum, antibiotics, CO2/O2 concentrations, etc.)


提供培養(yǎng)基、性質(zhì)、來源、所用補(bǔ)充物詳細(xì)信息

(生長(zhǎng)因子、葡萄糖、血清、抗生素、CO2/O2濃度等)

Describe   the sequence and duration of differentiation treatments.


描述分化處理的順序和持續(xù)時(shí)間。

Are the culture substrates treated?

YES/NO

培養(yǎng)基是否經(jīng)過處理?

Describe   the seeding conditions and frequency of media changes


描述接種條件和培養(yǎng)基更換頻率

Is   there quality control for the differentiation process?

YES/NO

分化過程是否有質(zhì)量控制?


Provide details (e.g. morphology, material homogeneity, max and min confluence,

proliferation, functional test, monitoring of markers, possible sorting, mortality rate)


提供細(xì)胞分化的詳細(xì)信息

(如形態(tài)、材料均勻性、融合度、增殖、功能測(cè)試、標(biāo)記物、分類、死亡率)




Does the project include the generation of (3D) organoids? General considerations

YES/NO

該項(xiàng)目是否包括生成3D 類器官?一般注意事項(xiàng)

If   YES:



Provide details on culture media, nature, origin, supplements used

(e.g. growth factors glucose, serum, antibiotics, CO2/O2 concentrations, etc.).


提供培養(yǎng)基、性質(zhì)、來源、所用補(bǔ)充物詳細(xì)信息

(生長(zhǎng)因子、葡萄糖、血清、抗生素、CO2/O2濃度等)

Describe the sequence and duration of differentiation treatments


描述分化處理的順序和持續(xù)時(shí)間

Are the culture substrates treated?

YES/NO

培養(yǎng)基是否經(jīng)過處理?

Describe the seeding conditions and frequency of media changes.


描述接種條件和培養(yǎng)基更換頻率

Is   there quality control for the differentiation process?

YES/NO

分化過程是否有質(zhì)量控制?

Provide details (e.g. morphology, material homogeneity, max and min confluence,

proliferation, functional test, monitoring of markers, possible sorting, mortality rate).


提供細(xì)胞分化的詳細(xì)信息

(如形態(tài)、材料均勻性、融合度、增殖、功能測(cè)試、標(biāo)記物、分類、死亡率)




Does   organoid generation make use of matrices?

YES/NO

類器官的生成是否利用了基質(zhì)?

If   YES:



Describe the nature of the matrix

(matrigel, hydrogels, hyaluronic acid, human decellularized matrix, etc.)


描述接種基質(zhì)的性質(zhì)

(matrigel、水凝膠、透明質(zhì)酸、人脫細(xì)胞基質(zhì)材料等)

Give the matrix concentration.


給出基質(zhì)濃度。

Give details of the preparation method

(temperature,  polymerization time, drop or layer structure, etc.).


給出制備方法的詳細(xì)信息

(溫度、聚合時(shí)間、滴加或?qū)訝罱Y(jié)構(gòu)等)

Give the seeding density per matrix volume unit.


給出基質(zhì)單位體積的接種密度。

Specify the volume and number of drops of matrix per unit area in the culture medium.


培養(yǎng)基中每單位面積的基質(zhì)液滴體積和滴數(shù)

Specify the amount of medium depending on the size of the well.


根據(jù)孔的大小給出培養(yǎng)基的量

Describe the matrix dissociation method for organoid recovery.


描述回收類器官時(shí)基質(zhì)解離方法

Describe the organoid dissociation method used for their expansion.


描述類器官擴(kuò)增時(shí)的解離方法




Does the culture take place on a solid 3D substrate

(e.g. mineral substrate for bones, substrate for liquid-gas interfaces)?

YES/NO

培養(yǎng)是否在固體3D基質(zhì)上進(jìn)行

(如骨骼用礦物基質(zhì)、液-氣界面基質(zhì))?

If   YES:



Describe the preparation method for the 3D solid substrate

(composition of the medium to be freeze-dried, freeze-drying conditions).


描述3D固體基質(zhì)的制備方法

(待凍干的培養(yǎng)基組成、凍干條件)

Give details on the seeding method.


提供接種方法的詳細(xì)信息。

List biocompatible materials used

(PDMS, COC, Silicon, etc.):


列出所用生物相容性材料

(PDMS、COC、硅等)

Indicate chip design (provide a map).


說明芯片設(shè)計(jì)(提供一張圖)

Provide the physical characteristics of the chip.


提供芯片的物理特性




Does the organoid grow in suspension

(self-organisation)?

YES/NO

類器官是否在懸浮液中生長(zhǎng)?

If   YES:



Specify   the type of container.


指定容器類型。

Describe the nature and protocol for agitation.


描述基質(zhì)的性質(zhì)和攪拌方案

Indicate the nature and concentrations of matrices.


指出基質(zhì)的性質(zhì)和濃度




Does   the culture include multiple cell types?

YES/NO

培養(yǎng)物是否包含多種細(xì)胞類型?

If   YES:



Describe the sequence for co-culturing and adaptation of the co-culture media.


描述共培養(yǎng)、共培養(yǎng)培養(yǎng)基的順序。

Indicate  the proportions of cell types.


標(biāo)明細(xì)胞類型的比例。

 

Section 4. Organoid Characterisation(類器官表征)

       類器官表征應(yīng)根據(jù)擬議的類器官用途(研究、生物生產(chǎn)、臨床前和臨床用途)而定。科學(xué)界在研究中業(yè)已沿用的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)包括用于基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)翻譯后修飾(protein post translational modifications)、細(xì)胞代謝、器官特有的生物標(biāo)志物等結(jié)構(gòu)組學(xué)內(nèi)容,形態(tài)成像以及根據(jù)預(yù)期的類器官用途而定的具體功能測(cè)讀等。

MIAOU在線問卷問題

反饋

參考中文備注

Has a morphological/structural characterization been performed?

YES/NO

是否進(jìn)行了形態(tài)學(xué)/結(jié)構(gòu)表征?

If   YES:



Describe the appearance, size, shape

 [circularity, tubularity, regularity of contours (budding),   etc.].


描述外觀、大小、形狀[圓形度、管狀度、輪廓(出芽)規(guī)則性等

Evaluate opacity/ refringency.


評(píng)估不透明度/折射率

Quantify intra and inter-organoid homogeneity.


量化器官內(nèi)和器官間的同質(zhì)性

Give details of expected morphological, architectural and ultrastructural features,

and organisation of cell types (identity,  proportions, distribution).


提供預(yù)期的形態(tài)學(xué)、結(jié)構(gòu)和超微結(jié)構(gòu)特征以及組織細(xì)胞類型




Has a molecular characterisation been performed?

YES/NO

是否進(jìn)行了分子表征?

If   YES:



Provide elements of genomics, transcriptomics, metabolomics, proteomics.


提供基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組和蛋白質(zhì)組學(xué)信息

Indicate expected specific molecular markers, epigenetic characteristics.


指出預(yù)期的特異性分子標(biāo)記物、表觀遺傳特征




Has a functional characterisation been performed?

YES/NO

是否進(jìn)行了功能表征?

If YES:



What are the qualitative and (if possible) quantitative functional   characteristics?


定性和(如可能的話)定量的功能特征是什么?

If treatments are applied,

detail the treatment protocol, response to treatments(pharmacological, chemical, physical, hormonal, etc.), and evaluation(quantitative or qualitative).


如用于治療目的

說明治療方案、治療反應(yīng)(藥物、化學(xué)、物理、激素等)和評(píng)價(jià)(定量或定性)




Are traceability and organoid drift evaluated?

YES/NO

是否評(píng)價(jià)了可追溯性和類器官漂移?

If   YES:



Describe how the traceability of components is evaluated

(batches, suppliers etc., environments, complements).


描述如何評(píng)估組分的可追溯性

(批次、供應(yīng)商等、環(huán)境、補(bǔ)充物)

Indicate criteria for the traceability of conditioned media

(drift of cells used for conditioning, control of lines, such as those at the origin of the organoid), control of at least one of the growth factors).


給出條件培養(yǎng)基可追溯標(biāo)準(zhǔn),至少一種生長(zhǎng)因子質(zhì)控

Describe  the qualitative drift criteria

(morphological, structural, functional, molecular, etc.) specific to each organoid.

Specify  indices if applicable.


如適用,描述每種類器官的定性漂移標(biāo)準(zhǔn)

(形態(tài)學(xué)、結(jié)構(gòu)、功能、分子等)

How is robustness evaluated

(same starting cells, same organoid)? Specify indices if applicable.


如適用,如何評(píng)估穩(wěn)健性

(相同的起始細(xì)胞,相同的類器官)?

 

Section 5. Use Of Organoids(類器官的使用)

       類器官使用的關(guān)鍵要素是類器官制備和表征的穩(wěn)健性以及對(duì)類器官未來用途的預(yù)期,如實(shí)施GLP規(guī)范將促進(jìn)從基礎(chǔ)研究向臨床前研究的過渡。

MIAOU在線問卷問題

反饋

參考中文備注

Are  the organoids designed for basic research?

YES/NO

類器官是否設(shè)計(jì)用于基礎(chǔ)研究?

If   YES:



Is compliance with GLP required for organoid production?

YES/NO

類器官生產(chǎn)是否需符合GLP?

Give   details, if applicable.


提供詳細(xì)信息(如果適用)




Are the organoids designed for bioproduction?

YES/NO

類器官是否設(shè)計(jì)用于生物生產(chǎn)?

If   YES:



Is compliance with GLP

(good laboratory practice) required for organoid production?


類器官生產(chǎn)是否需遵守GLP法規(guī)?

Give   details, if applicable.


提供詳細(xì)信息(如果適用)




Are the organoids designed for preclinical research

(pharmacology,   toxicology, etc.)?

YES/NO

類器官是否設(shè)計(jì)用于臨床前研究

(藥理學(xué)、毒理學(xué)等)?

If   YES:



Indicate the functional similarity criteria between the organoid and the mimicked organ

(battery of controls to be performed, with target values).


指示類器官和模擬器官之間的功能相似性標(biāo)準(zhǔn)

(要執(zhí)行的一組控件,帶有目標(biāo)值)

Is the organoid to be used for the preclinical development of a drug candidate

(IND file)?

YES/NO

是用于候選藥物臨床前開發(fā)的類器官

(IND 文件)?

Indicate   the number of usable passages.


標(biāo)明可用傳代數(shù)。

Is the organoid used to define predictive signatures of responses

(companion   test)?

YES/NO

是否用類器官來定義反應(yīng)的預(yù)測(cè)性特征?

(配套檢測(cè))

Indicate   the number of usable passages.


標(biāo)明可用傳代數(shù)。

Is the organoid to be used to validate a care protocol (specific patient) on a cohort: choice of a therapy.

YES/NO

類器官是用來驗(yàn)證篩選特定患者的治療方案?

Indicate   the number of usable passages.


標(biāo)明可用傳代數(shù)。




Are  the organoids designed for clinical research

(personalized, predictive and regenerative medicine, transplantation, etc.)?

YES/NO/N.A.  

類器官是否設(shè)計(jì)用于臨床研究?

(個(gè)性化/預(yù)測(cè)性/再生醫(yī)學(xué)/移植等)

If   YES:



Is the organoid to be used for: a care protocol?

e.g., tumoroid that will   be used to test the efficacy of a chemotherapy, organoids used to optimize personalised medicine to orient a therapeutic choice.

YES/NO

類器官是否用于護(hù)理方案?

如:

用于測(cè)試化療療效的腫瘤類器官;

用于優(yōu)化個(gè)性化治療方案的類器官。

Specify the process for GMP certification, the total traceability of components, the   qualification of components.


說明GMP認(rèn)證流程、組件總可追溯性、組件鑒定

Give   criteria for the similarity between the organoid and the biopsy

(objective elements to support the plausibility of using an organoid for the choice of a therapy).


給出類器官和活檢之間相似性的標(biāo)準(zhǔn)

(支持用類器官選擇療法合理性的客觀要素)

Is the organoid to be used in regenerative medicine, as already done for cell and tissue therapies?

YES/NO

類器官是否像已用于細(xì)胞和組織療法一樣要用于再生醫(yī)學(xué)?

Specify the process for GMP certification, the total traceability of components, the qualification of components.


說明GMP認(rèn)證流程、組件總可追溯性、組件鑒定

Specify functionality and safety criteria

(derivation of biological material and evaluation of the risk of cancer).


說明功能和安全標(biāo)準(zhǔn)

(生物材料生成和癌癥風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估)




Are  the organoids to be used for other purposes?

YES/NO

類器官是否用于其他目的?

If   YES:



Specify   other uses of organoids


規(guī)定類器官的其他用途

 

【參考文獻(xiàn)】

[1] 張冰也,吳羿霏,杜新. 類器官技術(shù)在新藥研發(fā)中的應(yīng)用. 藥學(xué)進(jìn)展,2023, 47(11): 849-863

[2] Ruixin Yang, Yao Qi, Xiaoyan Zhang, et al. Living biobank: Standardization of organoid construction and challenges. Chin Med J. 2024 Dec 20;137(24):3050-3060.

[3] D5.1: Operational guidelines regarding organoids and organoid-related technologies (https://hybrida-project.eu/)